南非的BA.4/B.A.5,確診人數正快速增加中,南非第5波確立。
BA.4/5是BA.2的子系,因為免疫逃逸更強,傳播能力又勝過BA.2。BA.2已經是和麻疹平起平坐的傳染王者了,BA.4/5的R0值還要開出什麼外掛?穿牆嗎?瞬移嗎?飛天嗎?不會只是在路上遇到一個妹啊,確認過眼神,就中鏢了吧?
南非的BA.4/B.A.5,確診人數正快速增加中,南非第5波確立。
BA.4/5是BA.2的子系,因為免疫逃逸更強,傳播能力又勝過BA.2。BA.2已經是和麻疹平起平坐的傳染王者了,BA.4/5的R0值還要開出什麼外掛?穿牆嗎?瞬移嗎?飛天嗎?不會只是在路上遇到一個妹啊,確認過眼神,就中鏢了吧?
我對這波BA.2的推估。假設感染人口為15%,20%,30%,以邏輯斯諦函數計算(1),推估高點在5月20日至5月24日之間,單日確診在15萬至30萬人。
感染人口15%~30%只是猜測,大家可以看三個條件下推估數(圖上藍線)和實際數字的差異(紅色柱狀),來估計擬合程度。
圖上三張圖是國衛院在行政院簡報時公佈的,三個時間點分別是4月21日,4月28日和5月5日,對未來疫情做出推估。4月30日的預估值7天後還修正過,(由9599上調至13519)。
然而,比較實際每日確診數,每一次的推估都是低估,今天(5/7)的誤差22%,4月21日誤差達到50%。
兩週前4月24日,阿中部長和柯P市長分別推估,最高每日確診會到4.5萬至5萬。(如圖)
現在看來,顯然都低估,今天就要破4萬,很快兩個高點都會被突破。中央和北市有修正了推估,但很多事情要有時間要提前準備,比方快篩和口服藥,突然發現不夠,買了也不會馬上到貨。人力和行政系統跟不上個案的暴增,通報系統Lag,收不到居隔單,吃不到Paxlovid 。
快篩陽性視為確診,很重要。 第1,高風險病患可以提早給Paxlovid 口服藥。 第2,快篩陽性,病毒量比較高,比PCR陽性更危險。快篩測不到,也沒傳染力了。
國外研究,實名制這款羅氏快篩,偽陽性很低很低。測出兩條線沒問題,就是陽性。但看到一條線,偽陰性的機率比較高。【陽可信,陰不可信】。
很多人包括醫生不知道,抗病毒神藥輝瑞Paxlovid在台灣的使用指引,已經修改了。
新的給藥高風險病患,我歸納為"老菸腦慢免胖" =老人(>65歲),抽煙史,失能和精神疾病,慢性病(可能再加入癌症),免疫功能缺失疾病,肥胖(BMI>30),六種。
有網友在臉書發問:『北京市二千萬人口目前有二條傳播鏈。請問潘醫師知道台灣的統計有幾株病毒序列組嗎?現在已經不奢求知道台灣有幾條傳播鏈了。』
剛好這兩天我到GISAID網站下載了台灣各大實驗室辛苦上傳的基因序列,用NextClade整理如附圖,答案是:至少有6種不同的BA.2的分枝病毒株。
準到自已嚇一跳!今天本土23102例,我的預測值23122例只多了20,誤差0.08% 。曲線圖是四天前公告的(1)。
証明數學模型能預測流行病。政府先準備好物資,疫苗藥物快篩病房PCR機器,不要手忙腳亂。民眾了解趨勢,照顧老小/投資出遊/在家上學工作,知道何時該緊何時該鬆。
能對抗病毒,降低死亡率,唯有疫苗和Paxlovid 。南韓第二劑疫苗87%,第三劑68% ,65歲以上老人打完三劑高達90% ,3個數字都完勝台灣。韓國處方Paxlovid 一個月過10萬劑,也比台灣積極。
然而計算三個月以來,南韓染疫死亡高達16,000+人,,93.9%在60歲以上,首爾醫療超載,醫院冰櫃不夠用,火葬場爆滿。這情況換算成台灣人口,會有7,400人去世,只要一波,足以成為全年第六大死因。
今天本土+16936再創新高。現在台灣人最關心的事,就是疫情會多嚴重?還要多久?
先前臉書我貼過2張預估圖,第1張是指數函數的簡單推估,4/30誤差值是3.05%,第2張是邏輯斯諦函數的推估,5/1誤差2.4%,還可以(見左上表,木柵神童)。讓我有信心計算下去。以邏輯斯諦函數模型,假設30%人口感染,5月26日左右出現每日確診人數的高點,約30萬人(右上圖橘色線)。
食藥署破天荒快速通過,家用口水快篩Gmate (G妹?)專案輸入。韓國公司Philosys 製造,馬來西亞可網購,14.5馬幣約98新台幣(附圖)。廠家宣稱敏感度91% (九成陽性可測到,一成偽陰),特異度100% (少有偽陽)。使用過程: 30分鐘內禁食禁煙,吐口水滿1/4瓶,擠壓搖晃靜置5分鐘,換管頭,滴四滴等20分鐘結果。(原廠影片 https://youtu.be/9031053YBHc )
不必再忍受戳鼻之苦,對幼兒老人友善。預計進口3, 000萬份,希望儘快舖貨,疏解快篩排隊之亂。
今天11974例。疫情發展,有許多不同的預測,比方柯P 市長的50萬軟封城等。我更新了算法,在假定感染率30%的情況下,今天推估值是11,774,誤差200(見圖),新圖上有未來六日的推估。
指數型增長模型和一般以R0值估算的流行病學SIR或SEIR模型不同,假設性參數較少。嚴格來講,指數型增長不能說是等比級數或幾何級數,因為每天增加的比率會隨免疫的人多了而變小,不是"等"比,增加比值是微分方程,這微分方程也是指數級變動(有人看的懂這段外星文嗎?)上次5天前的預估圖(1)是增加比值固定的簡略算法,算出今天12,186 ,誤差212 (1.7%),但之後誤差會變大會高估。
破8千了,還會多高?還要多久?
以一張圖來感受。每百萬人每日確診數,台灣現在約380 ,相比四國,才剛開始。新加坡最高到3,000 ,紐西蘭到4,000 ,香港8,000 ,南韓7,000 。國外O海嘯一波要3個月左右,比過去4個月短。
這幾天台灣全國陽性率,猛然增加到10%左右,實在太高了。
陽性率是指PCR送驗個案裏,有多少比率被驗出來。4/1時台灣送驗3.6萬件,驗出104件,陽性率0.65%,到了4/26送驗6.4萬件,驗出6295件,陽性率9.81%。確診數增加60倍,送驗數才增加2倍。
今天破六千。居隔改3+4,三隔四篩,可說是大躍進,更接近共存,快要超英趕美了。
瑪麗歐的跳關,RPG越級打怪,艾爾登法環瞬移Bug。買PTT 登入1,000 次帳號,秒上八卦版發文帶風向。
周玉蔻PCR確診,之後驗幾次快篩都是陰性,6天後第2次PCR變陰性,花生什麼素?
請看圖。第一次PCR陽性CT值29.3,在那個階段,做抗原快篩,做幾次都會是陰性,因為快篩要陽性,PCR CT值不能超過27。之後病毒量減少,CT值變高,超過30+(或機器限定的上限),連PCR都驗不到了,所以第2次PCR陰性。
上海人口和台灣相近,曲線成長值得參考。上海這波較早從三月一日開始。把台灣3/25後每日新增線型放上去,很接近。綠色線預測台灣增加趨勢,和上海實際數字也吻合,都是指數級成長。上海3/28開始封,14天後數字才下降。台灣不想封了,上昇趨勢線會噴出。
今天好消息是輝瑞神藥P已有18萬人份抵台。如何快速投藥成了重中之重。我會寫篇文章分享英國網友經驗。 https://bit.ly/37zMuQw
我試著以指數增長(Exponential Growth )曲線,推估到月底的情況。個人意見,謹供參考。
三種方式計算,綠紅黃線差不多。理論值,實際上最大變數是檢驗量能。官方說每日最多19萬,以陽性率5%算,要看到每日一萬不太容易。這波很多論文偏好用 Doubling Time (累計人數增加一倍需要幾天)來估算比較,R0不好使。歐洲各國約2.8~3.2天,台灣長一點(右中圖),表示還可以。香港一度低到1.38天,只能寫個慘字。 https://bit.ly/3L1ZnRW
輝瑞最近在新英格蘭醫學期刊出版了Paxlovid(帕克斯洛維德)三期臨床論文(1)。揭露許多細節,讀完後我覺得,這是台灣最後的救贖了。
世界上最後一個Omicron/BA.2沒有大規模爆發的國家(快了?),如果台灣能大量進貨,提早期給高風險病患老年病患服用,能避免很多人染疫住院和死亡。