有網友在臉書發問:『北京市二千萬人口目前有二條傳播鏈。請問潘醫師知道台灣的統計有幾株病毒序列組嗎？現在已經不奢求知道台灣有幾條傳播鏈了。』
剛好這兩天我到GISAID網站下載了台灣各大實驗室辛苦上傳的基因序列，用NextClade整理如附圖，答案是:至少有6種不同的BA.2的分枝病毒株。
1)BA.2
BA.2和子系是現在台灣流行主要病毒株。最後測序到的Omimcron-BA.1是2022/2/6三個月前了，估計已經完全被BA.2取代掉。
我3個月前寫過，螳螂補蟬，黃雀在後，BA.2將取代Omicron ( https://bit.ly/3OWkKqf )，也寫過BA.2才是台灣終局之戰的對手。現在看全球的狀況這是正確的，99%都是BA.2了，木柵神童，是你?
BA.2傳播力比Omicron更高了50%，R0值在10-16，相當於過去傳播力王者麻疹，可能是史上最會傳染的病毒。台灣能守到現在已經很不簡單。
BA.2傳播力雖然比較強，但沒有比較毒，各國住院率沒有高過Omicron-BA.1 。不過，日本學者的預印本論文，使用倉鼠感染實驗發現 BA.2比BA.1更致病。另外香港研究認為，BA.2 對兒童的影響更大。
過去都說新冠病毒不容易感染小鼠，中研院做研究要用基因改造小鼠。但從Omicron之後，進化到連小鼠都能感染了。甚至有學者認為，Omicron是人類在一年半前傳給小鼠，在小鼠族群進化後，再傳回人類的。下水道中的小鼠樣本裏，發現了和Omicron接近的序列。嗯…..希望它們已經集體免疫了。
2)BA.2.2
BA.2.2和BA.2據說是上海流行主要病毒株，症狀差不多。
3)BA.2.3
BA.2.3在台灣就很出名了，包括新北科技廠群聚案，五分埔女店員案，北市聯醫和平院區護理師群聚，基隆警察與小吃店群聚案，大潭電廠工程群聚案。目前定序資料裏，它是BA.2系列裏最早在台灣出現的變種，採集時間是2022年1月4日，早在四個月前，我猜它是現在台灣流行最廣的病毒株，而且有不同的分枝。最早可能從境外移入最多的越南傳來。
4)BA.2.4
首次是在新加坡發現的，關鍵突變位是ORF6:M58K，有學者預測成長的優勢比BA.1.1高了16%，比BA.2高了46%。這個….看看就好。
5)BA.10
很多國家都出現過，沒有特別的研究。
6)BA.10.1
新加坡出現過，也沒有特別的研究。
目前在資料庫中的就這6種，最後一筆採集時間是3月24日，也不排除這一個月內境外傳入了其它變種。BA.2，目前全球已有75個變種子系。
新聞裏，台灣在3月18日有發現一例境外移入的Omicron 變種XE (Omicron-BA.1混BA.2)，據說傳染力高過BA.2有10% ，但序列還沒上傳到GISAID 網站。其它新聞裏南非示警的BA.4 和BA.5，還有號稱傳播力又更強的BA.2.12.1 (美國發現，南韓和香港有報告)，在台灣的資料裏，沒有看到。
大概就醬，報告完畢。
我以為不會有人關心這問題了呢。就讓我們，和病毒手牽著手，一起朝向共存的夕陽，流淚奔跑而去吧。 https://bit.ly/3vZ4A6Q
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